全基因组重测序服务

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 þ 全基因组重测序(Whole genome re-sequencing,WGS)

基因组重测序是在已知物种基因组的情况下进行测序。通过对该物种的不同个体或同一个体的不同组织进行基因组重测序,可从群体或个体水平全面挖掘基因组序列差异。该方法能以较低的成本获得大量、准确的基因组信息,对人类疾病及动植物育种研究等方面具有重大的指导意义。应用领域包括个体基因组变异检测、突变体功能突变位点定位、群体遗传学分析和全基因关联分析


全基因组重测序的优势

²  提供高分辨率的基因组碱基序列图谱;

²   将短插入和较长的片段结合使用,可对任何基因组进行特征分析;

²   发现通过其他方法可能尚未鉴定的致病等位基因;

²   识别潜在的致病性变异,为进行基因表达和调控机制的后续深入研究提供信息


全面了解基因变异

使用新一代测序(NGS)技术分析全基因组,可提供所有基因组改变的碱基序列图谱,包括单核苷酸变异(SNV)、插入和缺失、拷贝数变化及结构变异。双末端全基因组测序过程中会对DNA片段的两端进行测序,这可以增加参考比对似然值,并有利于检测基因组重组、重复序列和基因融合。


全基因组重测序技术路线

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中科普瑞科技服务团队参与lncRNA芯片发表相关文献

1.   Wang L, Li MY, Qu C, Miao WY, Yin Q, Liao J, Cao HT, Huang M, Wang K, Zuo E, Peng G, Zhang SX, Chen G, Li Q, Tang K, Yu Q, Li Z, Wong CC, Xu G, Jing N, Yu X, Li J. CRISPR-Cas9-mediated genome editing in one blastomere of two-cell embryos reveals a novel Tet3 function in regulating neocortical development. Cell Res(2017). IF14.812.

2.      Di DW, Wu L, Zhang L, An CW, Zhang TZ, Luo P, Gao HH, Kriechbaumer V, Guo GQ. Functional roles of Arabidopsis CKRC2/YUCCA8 gene and the involvement of PIF4 in the regulation of auxin biosynthesis by cytokinin. Sci Rep(2016). IF5.228.

3.      Chen W, Fang T, Zhou X, Zhang D, Shi X, Shi C. IncHI2 Plasmids Are Predominant in Antibiotic-Resistant Salmonella Isolates. Front Microbiol(2016). IF4.165.

4.      Chen J, Gu SY,Zheng J, Chen JM  Simultaneous removal of SO2 and NO in a rotating drum biofilter coupled with complexing absorption by FeII(EDTA)    Biochem Eng J(2016). IF2.463.

5.      Zhang H, Miao H, Li C, Wei L, Duan Y, Ma Q, Kong J, Xu F, Chang S. Ultra-dense SNP genetic map construction and identification of SiDt gene controlling the determinate growth habit in Sesamum indicum L. Sci Rep(2016). IF5.228.

6.      Wu L, Luo P, Di DW, Wang L, Wang M, Lu CK, Wei SD, Zhang L, Zhang TZ, Amakorová P, Strnad M, Novák O, Guo GQ. Forward genetic screen for auxin-deficient mutants by cytokinin. Sci Rep(2015). IF5.578.

7.      Xiong K, Chen Z, Zhu C, Li J, Hu X, Rao X, Cong Y.   Safety and immunogenicity of an attenuated Salmonella enterica serovar Paratyphi A vaccine candidate   Int.J Med Micro-biol (2015). IF3.614.

8.      Sun X, Ruan R, Lin L, Zhu C, Zhang T, Wang M, Li H, Yu D. Genomewide investigation into DNA elements and ABC transporters involved in imazalil resistance in Penicillium digitatum. FEMS Microbiol Lett(2013). IF2.049.






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